Sword Art Online Ang pangatlong panahon ay nagsimula sa Arko ng Underworld arc na may isang Kirito na mukhang mas masahol pa para sa pagkasira kaysa dati. Bagaman sinimulan niya ang kanyang pagtalon sa Underworld sa ilalim ng malagim na mga pangyayari dahil ang kanyang katawan ay sinaktan ng isang kahila-hilakbot na lason, kasalukuyang nahaharap siya sa gulo kapwa sa totoong at virtual na mundo. Ang premiere para sa bagong arko ay nagsiwalat ng isang Kirito na sa paanuman ay nanatili ang kanyang paggana sa katawan, ngunit binanggit ni Alice na nawala ni Kirito ang lahat ng kanyang emosyon kasama ang kanyang kakayahang magsalita. Ngunit ang pinakahuling yugto ng serye ay ipinaliwanag kung ano ang nangyari sa kanya pagkatapos ng laban sa Administrator.
Ang ikalawang yugto ng Digmaang Underworld ay sumira sa kumplikadong sitwasyon na naroroon ni Kirito na nagsimula sa paunang kilos ng una niyang kalapati sa Underworld kasama ang lahat ng kanyang alaala ng kanyang totoong mundo. Mahalaga, nang subukan niyang makipag-ugnay sa labas ng mundo pagkatapos ng laban ng Administrator, isang pagkawala ng kuryente ang sanhi ng isang maikling circuit sa kanyang virtual na sarili.
Tulad ng ipinaliwanag ni Higa, si Kirito ay nasa pinakapangit na sitwasyon. Matapos ang pag-atake ng lason ay umalis sa pagkasira ng neural network ni Kirito, sinimulan ni Raft ang kanyang paggamot sa pamamagitan ng pagharang sa kanyang mga alaala at ipadala siya sa Underworld. Ngunit may isang error na sanhi sa kanya upang mai-upload ng kumpletong kaalaman na siya ay nasa isang virtual na mundo na kasalukuyang nasa isang pinabilis na timeline. Bagaman hindi pa matagal ang lumipas simula nang magsimula siya sa totoong mundo, dalawang taon na siyang nasa Underworld.
Nang subukan niyang makipag-ugnay kay Raft sa pamamagitan ng console sa Central Cathedral matapos na talunin ang Administrator - na ginawa niya upang mai-save ang mga Fluctlight sa mundong ito mula sa pagtanggal pagkatapos ng kanyang paggaling at pagbabalik sa totoong mundo - isang lakas ng alon ang sanhi ng kanyang Fluctlight sa maikling circuit. Sapagkat sinisisi niya nang husto ang kanyang sarili para sa pagkamatay ni Eugeo, sinundan ito ng maikling circuit sa pamamagitan ng pag-deactivate ng kanyang 'ego.'
Kaya't ngayon ang virtual na sarili ni Kirito ay may isang maliit na maliit na itim na butas sa kanyang isipan kung saan dapat naroroon ang kanyang mga proseso ng pagpapasya. Ang katawan niya ay hindi nasaktan, ngunit ang magagawa lamang niya ay ang mga reaksiyong reflexive batay sa malalim na alaala. Ito ang dahilan kung bakit medyo lumalabas siya sa daang riles kapag nahiwalay mula sa espada ni Eugeo, at paminsan-minsan ay sumisigaw sa gabi. Hindi na niya alam kung sino siya, kung ano ang kanyang misyon, o maaaring magsalita nang siya lamang.
Hanggang sa maaayos ni Kirito ang kanyang sarili, magpapatuloy si Alice sa pakikibaka sa virtual na mundo at labas. Mayroong mga mersenaryo pagkatapos ng kanyang fluctlight, at ngayon ay hindi matandaan ni Kirito na protektahan siya dapat. Na nangangahulugang ang arko ng War of Underworld ay mas maraming layered kaysa sa paunang inaasahan. Kung nais mong tumalon pabalik sa serye, maaari mo ngayong makita Sword Art Online: Alicization - Digmaan ng Underworld streaming sa Crunchyroll, Funimation, HIDIVE, at Hulu.
